Уголовное дело возбуждено по статье "мошенничество, совершенное организованной группой в особо крупном размере" (часть 4. ст.159 УК).
Как полагает следствие, к мошенническим действиям причастно руководство компании "ЮКОС Капитал С.а.р.л.". Указанная компания в настоящее время выступает в качестве одного из основных кредиторов в процедуре банкротства "ЮКОСа".
По мнению следователей, кредиты, предоставленные "ЮКОСом" и его дочерним структурам – корпорациям "Юганскнефтегаз", "Самаранефтегаз", "Томскнефть", "ЮКОС Восток Трейд", "Энерготрейд", на общую сумму свыше 4,5 миллиардов, были получены компанией "ЮКОС Капитал С.а.р.л." путем использования цепочки аффилированных с НК "ЮКОС" юридических лиц, в том числе и расположенных заграницей.
В настоящее время следствие проводит выемки документов в офисах перечисленных компаний, допросы сотрудников указанных юридических лиц, а также выемку банковских документов, касающихся счетов компании "ЮКОС Капитал С.а.р.л." и документов о ее участии в процедуре банкротства и связанных с нею судебных процессах.
Счета и акции "ЮКОСа" и его крупнейших "дочек" в настоящее время арестованы, большая часть поступающих на них средств изымается для погашения налоговой задолженности. Многочисленные налоговые претензии предъявлялись "ЮКОСу" с конца 2003 года. Общий долг "ЮКОСа" перед 30 кредиторами, подтвержденный судом, составляет 492 млрд руб. (включая штраф и пенни), из которых 353,7 млрд руб.- задолженность перед налоговыми органами, 109 млрд руб. -перед "Юганснефтегазом" (проданном в декабре 2005г. "Роснефти" для погашения налоговых претензий), около 13 млрд руб. - перед "Роснефтью".